Une programmation spécifique est mise en place pour les différents niveaux scolaires, de la maternelle au lycée et tous assistent comme des grands, parfois pour la première fois, aux séances concoctées pour eux.
Les plus petits découvrent des films d’animation adaptés à leur âge et des dossiers pédagogiques sont fournis aux enseignants afin qu’ils puissent travailler en amont avec leurs élèves.
Les collégiens et lycéens participent aux projections de films issus de la programmation du Festival et rencontrent les réalisateurs, acteurs, compositeurs des films pour un échange à la suite de chaque film. Le choix des séances est étudié afin que les enseignants puissent établir des passerelles entre les expériences cinématographiques des élèves et le travail en classe.

Depuis plus de 20 ans et grâce au soutien de la Région Normandie, le Festival organise le Prix de la Jeunesse. 6 lycéens, venus de toute la Région, sont invités chaque année à suivre la compétition des longs métrages, au même titre que le Grand Jury. Ils donnent ainsi une voix à la jeunesse en décernant le Prix de la Jeunesse lors de la Cérémonie des Swann d’Or.

Depuis deux ans maintenant, le Festival invite également chaque année six étudiants de l'Université de Caen à constituer un jury dédié et à remettre leur propre prix lors de la cérémonie du palmarès des Courts métrages du vendredi soir. Cette initiative est portée cojointement avec le CROUS de Caen et le Cinéma Lux de Caen.